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我国加速基因组编写弯道超车--国际基因组编写计划·中国”在深启动

发表于 2018-2-5

12月2日,中国科学院深圳先进技术研究院(简称“先进院”)“中美合成生物学院士高端论坛暨合成生物学研究所(筹)成立揭牌仪式”在深圳举办。该研究所拥有3个中美院士实验室、12个海归PI实验室,汇聚了合成生物学顶尖科学家,正在搭建国内最大的合成生物学研究平台,将有望成长为屹立东方的一所具有世界影响力的合成生物学研究机构。随后,“国际基因组编写计划·中国”启动仪式举行。...

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pubmed不行了之后,用什么快速搜文献?

发表于 2018-2-2

在美国财政紧张的背景下,pubmed的经费没有得到及时供给,从而暂停了相应文章的更新,这对大家来说,产生了重要的影响。 那么我们该如何来搜索文献那? 这里,我们来了解更好的搜索文献方法--- web of knowlege,这就是 我们常说的SCI 收录方。我们可以通过web of knowledge 更加精准的获得相应的文献。 ...

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我国加速基因组编写弯道超车--国际基因组编写计划中国在深启动

发表于 2018-2-2

12月2日,中国科学院深圳先进技术研究院(简称“先进院”)“中美合成生物学院士高端论坛暨合成生物学研究所(筹)成立揭牌仪式”在深圳举办。该研究所拥有3个中美院士实验室、12个海归PI实验室,汇聚了合成生物学顶尖科学家,正在搭建国内最大的合成生物学研究平台,将有望成长为屹立东方的一所具有世界影响力的合成生物学研究机构。随后,“国际基因组编写计划·中国”启动仪式举行。...

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NIBS 3名毕业生入选第14批国家“青年千人计划”

发表于 2018-1-31

北京生命科学研究所(以下简称北生所)有2名毕业生入选第14批国家“青年千人计划”人才名单,他们分别是杨红春和罗树坤。另有1名在北生所做过本科毕业论文的徐振江也入选本批“青年千人计划”。...

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浙大张龙课题组连发重磅文章解析癌症外泌体与迁移新机制

发表于 2018-1-30

2018年1月22日,张龙课题组在Nature Immunology上发表题为“Tumor-derived exosomes antagonize innate antiviral immunity”的研究论文,揭示肿瘤外泌体在宿主固有免疫失衡中的重要作用,并阐明了关键分子机制。 与正常人相比,一部分恶性癌症患者会出现机体免疫系统失衡。部分肿瘤病人会出现免疫力低下,容易感染病毒性疾病因而出现、甚至死于并发症。但目前对于这一部分恶性肿瘤病人为何会出现固有免疫力低下缺乏研究。为探索其中的原因与可能的机制,研究人员建立了体外和体内实验模型,发现恶性肿瘤细胞往往能够通过分泌大量外泌体抑制宿主固有免疫。进一步通过体外外泌体的大量获取和质谱研究,研究人员证实恶性肿瘤细胞外泌体大量含有并能传递活化型的EGFR抑制宿主细胞一型干扰素的产生。 高度活化的EGFR能引起MEKK2活化、IRF3的Ser173的磷酸化和与之偶联的Lys77发生K33-链连接的泛素化,从而破坏IRF3的核定位功能因而抑制一型干扰素的产生。该工作不仅首次揭示了部分肿瘤病人固有免疫低下的原因,同时阐明了可能的分子机制,具有重要的临床意义,能够为晚期癌症病人的治疗提供一个新的策略和理论依据。外泌体领域是一个新的研究方向,其未知的生理病理功能亟待研究;因此,该项研究也为外泌体的功能解析提供了新的方法和新的探索方向。 浙江大学生命科学研究院张龙课题组和苏州大学周芳芳课题组博士研究生高亮、硕士研究生王林、博士研究生代通、博士后金珂和博士研究生张正奎为共同第一作者,浙江大学张龙教授为本文的通讯作者,苏州大学周芳芳教授为共同通讯作者。该项研究得到了科技部"蛋白质机器与生命过程调控"重点研发计划“肿瘤外泌体:介导肿瘤筑巢和转移的蛋白质机器”(2016YFA0502500),国家自然科学基金(31701232,31571460,31471315,31671457和91753139),浙江省杰出青年基金(LR14C070001)以及江苏省自然科学基金(BK20150354)等项目资助。 2017年12月13日,张龙课题组在Nature Communications杂志上在线发表题为“Breast cancer metastasis suppressor OTUD1 deubiquitinates SMAD7”的研究论文。该文章发现了新的肿瘤转移抑制因子OTUD1(OTU domain-containing protein 1),并阐明其抑制肿瘤转移的分子机制,证实该因子抑制功能的丢失将会促进肿瘤的恶化。 肿瘤转移是导致癌症病人死亡的一个非常重要的原因,多达90%的实体瘤患者死于肿瘤转移。为探究新的转移关键因子,研究者建立了小鼠体内肿瘤转移的筛选模型,通过体内筛选去泛素化酶shRNA文库,发现了一个新的肿瘤转移抑制因子去泛素化酶OTUD1。 通过功能实验,研究者发现OTUD1是通过抑制肿瘤干性来拮抗肿瘤转移的,并且其功能依赖于去泛素化酶活性。进一步研究发现,OTUD1靶向转移生长因子β (TGF-β)信号通路,通过分子机制的探究,发现OTUD1去泛素化TGF-β信号通路的主要抑制蛋白SMDA7,一方面OTUD1去泛素SMAD7的K48泛素化链从而稳定SMAD7的蛋白水平,另一方面特异性的切除SMAD7上的K33泛素化链,稳定SMAD7-SMURF2复合物的形成从而促进TβRI降解。OTUD1抑癌功能的丧失与病人的不良预后呈正相关。 此项研究不仅发现了调控肿瘤转移新的抑制因子OTUD1,而且揭示了OTUD1如何通过去泛素化SMAD7抑制TGF-β信号的分子机制,解释了在晚期肿瘤中OTUD1抑制功能的丢失促进了TGF-β向促癌功能的转变,对临床预防肿瘤恶化和抗癌药物的研究提供了重要的理论支持。体内基因筛选将OTUD1鉴定为乳腺癌转移的抑制因子(Left panel) 。OTUD1去泛素化SMAD7的K48泛素化链稳定SMAD7;去泛素SMAD7的K33泛素化链,稳定SMAD7-SMURF2复合物促进TβRI降解抑制TGF-β信号通路(middle&Right panels) 张龙实验室博士生张正奎,硕士生范瑶和已毕业博士生谢枫是该文的共同第一作者,张龙教授是本文的通讯作者。该研究受到科技部"蛋白质机器与生命过程调控"重点专项、国家自然科学基金、浙江省重点研究发展项目、浙江省杰出青年基金等项目资助。 ...

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清华肖百龙与李雪明课题组合作在《自然》发文

发表于 2018-1-29

2018年1月22日,《自然》期刊以长文形式在线发表了清华大学肖百龙与李雪明课题组题为《Piezo1离子通道的结构与机械门控机制》(Structure and Mechanogating Mechanism of the Piezo1 Channel)的研究论文,他们解析了哺乳动物机械门控Piezo1离子通道的高分辨率三维结构,揭示了其参与机械力感受与传递的关键功能位点,进而首次提出了Piezo通道以类似杠杆原理进行机械门控的精巧工作机制。...

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合成生物学重点专项来临! 我国合成生物学迎腾飞风口

发表于 2018-1-29

合成生物学以工程化设计理念,对生物体进行有目标的设计、改造乃至重新合成。“合成生物学”重点专项总体目标是针对人工合成生物创建的重大科学问题,围绕物质转化、生态环境保护、医疗水平提高、农业增产等重大需求,突破合成生物学的基本科学问题,构建几个实用性的重大人工生物体系,创新合成生物前沿技术,为促进生物产业创新发展与经济绿色增长等做出重大科技支撑。...

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OPENI--NIH的实验图片搜索引擎-加速你的科研

发表于 2018-1-22

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绝对干货-如何免费下载JOVE实验操作视频提高自己技术

发表于 2018-1-19

作为一个可视化实验技术学习杂志,JOVE提供了太多太多的实验技能,我们可以通过学习JOVE中的视频提高自己的知识水平,然而由于权限和方法,我们无法直接下载JOVE的视频资料,为了方便,今天我们特意奉上JOVE视频下载方法:...

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跟JOVE学习蛋白纯化(一)-详细步骤-有图有真相

发表于 2018-1-18

今天要纯化的目的蛋白为MOG,为了纯化这个蛋白,首先将目的蛋白构建到质粒上。并添加相应的tag。...

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陈春来课题组《Cell Reports》报道Cas9蛋白切割调控和校验机制

发表于 2018-1-15

2018年1月9日,清华大学生命科学学院陈春来研究组在《Cell Reports》杂志发表了研究论文,题目为“The Conformational Dynamics of Cas9 Governing DNA Cleavage Are Revealed by Single-Molecule FRET”(利用单分子FRET揭示Cas9在DNA切割过程中的动态构象)。该论文展示了Cas9可以自发地在三种主要构象中转换,揭示了Cas9蛋白与PAM远端DNA/RNA双链相互作用可长程别构调控Cas9切割结构域的局部构象,这是Cas9切割靶标DNA之前的最后校验步骤。最后,该文提出了优化和设计高保真Cas9的新思路,即通过突变Cas9蛋白以影响这种长程别构调控机制,可提高Cas9的识别特异性。...

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娄继忠课题组在CRISPR-Cas9系统R-loop复合体机制研究中获得进展

发表于 2018-1-15

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陈春来课题组《Cell Reports》报道Cas9蛋白切割调控和校验机制

发表于 2018-1-12

2018年1月9日,清华大学生命科学学院陈春来研究组在《Cell Reports》杂志发表了研究论文,题目为“The Conformational Dynamics of Cas9 Governing DNA Cleavage Are Revealed by Single-Molecule FRET”(利用单分子FRET揭示Cas9在DNA切割过程中的动态构象)。该论文展示了Cas9可以自发地在三种主要构象中转换,揭示了Cas9蛋白与PAM远端DNA/RNA双链相互作用可长程别构调控Cas9切割结构域的局部构象,这是Cas9切割靶标DNA之前的最后校验步骤。最后,该文提出了优化和设计高保真Cas9的新思路,即通过突变Cas9蛋白以影响这种长程别构调控机制,可提高Cas9的识别特异性。...

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快讯|施一公请辞清华大学副校长-全职执掌西湖大学

发表于 2018-1-10

今日,由中国新闻周刊公众号独家报道,根据多个渠道证实,施一公将辞去清华大学副校长职务。但保留清华的教授职务,这是为了全身心投入到西湖大学。...

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如同航天员-我国首个P4生物实验室建成

发表于 2018-1-10

中国科学院武汉国家生物安全四级实验室通过国家卫计委高致病性病原微生物实验活动现场评估,成为中国首个正式投入运行的P4实验室,标志着我国具有开展高级别高致病性病原微生物实验活动的能力和条件。...

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「番茄科研法」读博士太单调、战斗太低效怎么办?

发表于 2018-1-9

作为一个读博士四年,头发快没了的博士,常常感慨,日复一日做类似的事情,感觉不到自己的进步,慵懒无为,实验操作太低效怎么办?...

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“下一代工业生物技术”获突破 有助于解决白色污染问题

发表于 2018-1-4

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回首17 · 展望 18-我去年的成长心得

发表于 2018-1-3

2018年就这样悄然而至了,朋友圈火爆的18岁晒照片,也没有参加,向来觉得实在不想凑热闹,那就总结点东西吧,积累这一年的成长:...

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施一与田克恭组发现伪狂犬病毒中和抗体

发表于 2017-12-27

近日,中国科学院微生物研究所病原微生物与免疫重点实验室施一研究组与河南农业大学、国家兽用药品工程技术研究中心田克恭教授合作,在靶向伪狂犬病毒(Pseudorabies virus, PRV)囊膜糖蛋白gB的中和抗体研究方面取得重要进展,为伪狂犬病毒疫苗和抗体研发提供了重要理论基础。...

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精准医学:人类医学的一轮革命― <<Quantitative Biology>>

发表于 2017-12-26

近年来,精准医学受到广泛关注,为了集中体现精准医学发展的脉络和前沿的进展,<>特推出精准医学专刊,从多个层面进行了展示。专刊特别编辑为来自美国埃默里大学(Emory University)的Zhaohui S. Qin博士。 2011年,美国科学院、工程院和国立卫生研究院以及美国科学委员会共同发出了“迈向精准医学”的倡议,2015年,时任美国总统奥巴马提出了“精准医学”计划,呼吁增加医学研究经费,推动个体化研究,依据个人基因信息为癌症和其他疾病患者制定个性化医疗方案。...

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